Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms