Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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CTF1Q16619 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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CTF1Q16619 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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