Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD4Q13485 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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