Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUSC3Q13454 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.6 ms