Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
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LSAMPQ13449 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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LSAMPQ13449 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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LSAMPQ13449 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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