Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
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