Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MSLNQ13421 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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