Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms