| NME3 | Q13232 | RNU6-144P-201 | ENST00000383951 | 107 nt | BASIC | 0.58 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-42P-201 | ENST00000384165 | 107 nt | BASIC | 0.58 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR215-201 | ENST00000384858 | 110 nt | BASIC | 0.58 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-101P-201 | ENST00000410323 | 104 nt | BASIC | 0.58 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AC090844.1-201 | ENST00000422019 | 156 nt | BASIC | 0.58 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AC015818.7-201 | ENST00000428754 | 109 nt | BASIC | 0.58 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AC087499.7-201 | ENST00000441958 | 109 nt | BASIC | 0.58 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AC095059.1-201 | ENST00000502570 | 349 nt | TSL 5 BASIC | 0.58 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AL117351.2-201 | ENST00000513571 | 157 nt | BASIC | 0.58 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | SCARNA8-201 | ENST00000515924 | 131 nt | BASIC | 0.58 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.666-201 | ENST00000516187 | 112 nt | BASIC | 0.58 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | uc_338.4-201 | ENST00000616635 | 176 nt | BASIC | 0.58 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RMST_2.1-201 | ENST00000617263 | 136 nt | BASIC | 0.58 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.28-201 | ENST00000362554 | 111 nt | BASIC | 0.57 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | snoU2_19.2-201 | ENST00000363024 | 80 nt | BASIC | 0.57 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.242-201 | ENST00000364473 | 110 nt | BASIC | 0.57 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-290P-201 | ENST00000365212 | 101 nt | BASIC | 0.57 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | IL6ST-202 | ENST00000381286 | 201 nt | TSL 1 (best) BASIC | 0.57 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNY1P8-201 | ENST00000383970 | 114 nt | BASIC | 0.57 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.541-201 | ENST00000384640 | 113 nt | BASIC | 0.57 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RPL21P38-201 | ENST00000418090 | 167 nt | BASIC | 0.57 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | BTF3P11-201 | ENST00000426582 | 477 nt | BASIC | 0.57 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR5692C2-201 | ENST00000577959 | 77 nt | BASIC | 0.57 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AL512605.2-201 | ENST00000592972 | 256 nt | BASIC | 0.57 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | MT-CO2-201 | ENST00000361739 | 684 nt | APPRIS P1 BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR377-201 | ENST00000362145 | 69 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNA5SP499-201 | ENST00000363982 | 119 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-806P-201 | ENST00000365147 | 105 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-662P-201 | ENST00000384253 | 104 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | MT-TN-201 | ENST00000387400 | 73 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | CPEB3_ribozyme.1-201 | ENST00000408115 | 78 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-733P-201 | ENST00000410759 | 104 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNA5SP222-201 | ENST00000411039 | 105 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD83.1-201 | ENST00000411362 | 77 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | ELOCP20-201 | ENST00000422460 | 345 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AC023449.1-201 | ENST00000454464 | 154 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AC007751.1-201 | ENST00000529260 | 376 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | uc_338.17-201 | ENST00000619633 | 179 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AL160413.1-201 | ENST00000622780 | 310 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | C18orf54-201 | ENST00000300091 | 5237 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | ZNF518A-209 | ENST00000614149 | 7911 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 0.55 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR367-201 | ENST00000362299 | 68 nt | BASIC | 0.55 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.14-201 | ENST00000362415 | 103 nt | BASIC | 0.55 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.26-201 | ENST00000362539 | 101 nt | BASIC | 0.55 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.241-201 | ENST00000364470 | 117 nt | BASIC | 0.55 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-580P-201 | ENST00000365159 | 107 nt | BASIC | 0.55 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-945P-201 | ENST00000383947 | 107 nt | BASIC | 0.55 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR518E-201 | ENST00000385252 | 88 nt | BASIC | 0.55 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AC091959.1-201 | ENST00000495857 | 238 nt | BASIC | 0.55 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORA40.15-201 | ENST00000516884 | 107 nt | BASIC | 0.55 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU2-31P-201 | ENST00000516954 | 155 nt | BASIC | 0.55 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AC087362.2-201 | ENST00000529325 | 256 nt | TSL 3 BASIC | 0.55 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORA25.1-201 | ENST00000362326 | 128 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNA5SP347-201 | ENST00000362445 | 119 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.122-201 | ENST00000363331 | 96 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU4-10P-201 | ENST00000364383 | 140 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.293-201 | ENST00000364908 | 93 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-1138P-201 | ENST00000365359 | 106 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.376-201 | ENST00000365638 | 108 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORA24-201 | ENST00000384096 | 131 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AC098934.3-201 | ENST00000430450 | 190 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | DIP2A-IT1-201 | ENST00000442434 | 428 nt | TSL 2 BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AL157398.1-201 | ENST00000452981 | 186 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.631-201 | ENST00000459607 | 101 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU4-54P-201 | ENST00000516428 | 129 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-229P-201 | ENST00000516614 | 102 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.721-201 | ENST00000517207 | 102 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AC113192.4-201 | ENST00000534666 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR4724-201 | ENST00000579485 | 89 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AP000753.3-201 | ENST00000604083 | 169 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AL008718.3-201 | ENST00000610217 | 321 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AC022709.1-201 | ENST00000615967 | 87 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AC134878.1-201 | ENST00000619901 | 243 nt | BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.214-201 | ENST00000364201 | 112 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU1-133P-201 | ENST00000364867 | 167 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORA22B-201 | ENST00000383876 | 138 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORA36.2-201 | ENST00000384004 | 127 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.486-201 | ENST00000384398 | 107 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNA5SP496-201 | ENST00000391240 | 109 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | MTND4LP11-201 | ENST00000422184 | 280 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU7-67P-201 | ENST00000459003 | 62 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-1132P-201 | ENST00000459214 | 107 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNA5SP436-201 | ENST00000516020 | 115 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD77.4-201 | ENST00000516158 | 81 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNY3P15-201 | ENST00000516297 | 97 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-988P-201 | ENST00000519081 | 107 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | AC131281.1-201 | ENST00000522984 | 164 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR4264-201 | ENST00000583520 | 66 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | uc_338.6-201 | ENST00000613544 | 171 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | NPPA-AS1_2.1-201 | ENST00000618496 | 149 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | EVI2B-201 | ENST00000330927 | 1999 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.16-201 | ENST00000362421 | 102 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD115-34-201 | ENST00000362441 | 82 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.19-201 | ENST00000362462 | 99 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD115-12-201 | ENST00000362583 | 82 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD115-29-201 | ENST00000362834 | 82 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD115-9-201 | ENST00000362912 | 82 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD115-21-201 | ENST00000362963 | 81 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD115-14-201 | ENST00000363090 | 81 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD115-13-201 | ENST00000363358 | 82 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |