Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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ERCC8Q13216 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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ERCC8Q13216 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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ERCC8Q13216 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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ERCC8Q13216 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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ERCC8Q13216 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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ERCC8Q13216 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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ERCC8Q13216 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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ERCC8Q13216 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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