Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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CBX3Q13185 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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CBX3Q13185 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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CBX3Q13185 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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