Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
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