Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
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GTF3C1Q12789 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
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