Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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SFTPDP35247 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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SFTPDP35247 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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SFTPDP35247 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
SFTPDP35247 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFTPDP35247 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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