Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
VDRP11473 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VDRP11473 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VDRP11473 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VDRP11473 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VDRP11473 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VDRP11473 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VDRP11473 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VDRP11473 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VDRP11473 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
VDRP11473 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VDRP11473 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VDRP11473 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VDRP11473 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VDRP11473 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VDRP11473 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VDRP11473 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
VDRP11473 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VDRP11473 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VDRP11473 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VDRP11473 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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