Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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