Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRPF3Q9ULD4 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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