Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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RRN3Q9NYV6 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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RRN3Q9NYV6 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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RRN3Q9NYV6 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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