Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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ATG4CQ96DT6 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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