Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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