Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX54Q8TDD1 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms