Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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