Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USF2Q15853 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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