Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.7 ms