Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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