Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1DQ13901 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1DQ13901 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1DQ13901 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1DQ13901 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1DQ13901 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1DQ13901 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1DQ13901 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1DQ13901 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1DQ13901 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1DQ13901 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1DQ13901 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1DQ13901 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1DQ13901 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1DQ13901 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1DQ13901 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1DQ13901 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1DQ13901 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1DQ13901 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1DQ13901 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1DQ13901 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.8 ms