Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOFQ13790 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOFQ13790 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOFQ13790 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOFQ13790 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOFQ13790 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOFQ13790 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOFQ13790 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOFQ13790 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
APOFQ13790 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
APOFQ13790 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
APOFQ13790 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms