Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1SQ13698 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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