Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PPFIA1Q13136 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PPFIA1Q13136 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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