Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
STRN3Q13033 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
STRN3Q13033 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.7 ms