Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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CNTN1Q12860 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNTN1Q12860 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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