Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
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GTF3C1Q12789 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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GTF3C1Q12789 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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GTF3C1Q12789 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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GTF3C1Q12789 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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GTF3C1Q12789 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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GTF3C1Q12789 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GTF3C1Q12789 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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