Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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