Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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