Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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FAM3DQ96BQ1 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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FAM3DQ96BQ1 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FAM3DQ96BQ1 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
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FAM3DQ96BQ1 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FAM3DQ96BQ1 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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FAM3DQ96BQ1 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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