Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KNOP1Q1ED39 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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