Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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