Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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