Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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NR1I3Q14994 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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NR1I3Q14994 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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NR1I3Q14994 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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NR1I3Q14994 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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NR1I3Q14994 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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NR1I3Q14994 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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NR1I3Q14994 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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NR1I3Q14994 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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NR1I3Q14994 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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NR1I3Q14994 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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NR1I3Q14994 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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NR1I3Q14994 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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NR1I3Q14994 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1I3Q14994 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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