Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IRF3Q14653 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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