Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ALCAMQ13740 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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