Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SMAD4Q13485 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD4Q13485 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD4Q13485 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD4Q13485 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD4Q13485 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD4Q13485 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD4Q13485 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD4Q13485 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD4Q13485 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD4Q13485 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SMAD4Q13485 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD4Q13485 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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