Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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