Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms