Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CBX3Q13185 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
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