Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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