Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTP4A2Q12974 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTP4A2Q12974 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms