| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.641-201 | ENST00000459414 | 105 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | snoU18.1-201 | ENST00000629629 | 71 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR335-201 | ENST00000362173 | 94 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.275-201 | ENST00000364726 | 110 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORD38C-201 | ENST00000384381 | 69 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR516B2-201 | ENST00000385190 | 85 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNA5SP247-201 | ENST00000411181 | 105 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | BTF3P4-201 | ENST00000418852 | 495 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC015922.2-201 | ENST00000435593 | 184 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU1-123P-201 | ENST00000458950 | 160 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC004223.1-201 | ENST00000479840 | 271 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC055733.2-201 | ENST00000504737 | 340 nt | TSL 2 BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AP001282.2-201 | ENST00000616149 | 309 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | GNAS-AS1_4.1-201 | ENST00000616546 | 112 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | ZNF209P-201 | ENST00000593450 | 2304 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.47-201 | ENST00000362697 | 108 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-1289P-201 | ENST00000384431 | 106 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORD41-201 | ENST00000386967 | 70 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6ATAC3P-201 | ENST00000387974 | 126 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNA5SP496-201 | ENST00000391240 | 109 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | LINC02534-201 | ENST00000446525 | 283 nt | TSL 3 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-1045P-201 | ENST00000516321 | 107 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC084365.1-201 | ENST00000552470 | 310 nt | TSL 3 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL122017.1-202 | ENST00000570612 | 319 nt | TSL 5 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR3660-201 | ENST00000584845 | 100 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC006006.1-201 | ENST00000603082 | 144 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Metazoa_SRP.32-201 | ENST00000622685 | 286 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-1309P-201 | ENST00000363305 | 108 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR1302-3-201 | ENST00000408128 | 138 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MTND2P23-201 | ENST00000422990 | 651 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC090142.3-201 | ENST00000519012 | 385 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | DNAJC19P9-201 | ENST00000555084 | 351 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | TRAJ36-201 | ENST00000614481 | 58 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.802-201 | ENST00000614892 | 130 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-383P-201 | ENST00000410864 | 94 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC009474.2-201 | ENST00000451383 | 136 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU7-95P-201 | ENST00000459222 | 64 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | NDUFA4P2-201 | ENST00000489989 | 244 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC017015.2-201 | ENST00000497946 | 376 nt | TSL 2 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SCARNA15.1-201 | ENST00000516384 | 125 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC008507.4-201 | ENST00000585464 | 127 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL008718.3-201 | ENST00000610217 | 321 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | U2.14-201 | ENST00000615943 | 113 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SENP7-207 | ENST00000394095 | 4945 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-211P-201 | ENST00000384047 | 107 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORD26-201 | ENST00000384147 | 75 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.483-201 | ENST00000384380 | 101 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MT-TW-201 | ENST00000387382 | 68 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AP1B1P2-201 | ENST00000416196 | 106 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL358176.2-201 | ENST00000425769 | 204 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORD11-201 | ENST00000459124 | 84 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | TRMT112P2-201 | ENST00000512910 | 132 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.679-201 | ENST00000516416 | 91 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORD111.1-201 | ENST00000516421 | 86 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-165P-201 | ENST00000517170 | 99 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR4421-201 | ENST00000578133 | 69 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR5688-201 | ENST00000580619 | 83 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR4781-201 | ENST00000585250 | 76 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL359821.1-201 | ENST00000605519 | 182 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | FAM135A-203 | ENST00000370479 | 5930 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR26B-201 | ENST00000362251 | 77 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.556-201 | ENST00000384677 | 113 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORA8.3-201 | ENST00000384679 | 139 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR526A2-201 | ENST00000390198 | 65 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORA40.6-201 | ENST00000391153 | 128 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.590-201 | ENST00000410140 | 107 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC078980.1-201 | ENST00000485384 | 262 nt | TSL 2 BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MTCO2P24-201 | ENST00000515611 | 426 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORA18.7-201 | ENST00000516910 | 131 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORA74.3-201 | ENST00000517108 | 154 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | LINC02277-202 | ENST00000556472 | 453 nt | TSL 3 BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.117-201 | ENST00000363294 | 101 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-740P-201 | ENST00000364734 | 105 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORA25.8-201 | ENST00000364831 | 128 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.288-201 | ENST00000364854 | 92 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-321P-201 | ENST00000410912 | 106 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL162411.1-201 | ENST00000413145 | 526 nt | TSL 2 BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC068658.1-201 | ENST00000507509 | 388 nt | TSL 2 BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORA31.4-201 | ENST00000516049 | 129 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC019288.1-201 | ENST00000557918 | 224 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC138625.2-201 | ENST00000563968 | 551 nt | TSL 3 BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | uc_338.4-201 | ENST00000616635 | 176 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | DENND4A-209 | ENST00000635620 | 5887 nt | TSL 5 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR520C-201 | ENST00000385005 | 87 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORA31.2-201 | ENST00000516019 | 134 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU1-92P-201 | ENST00000517017 | 135 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL049861.1-201 | ENST00000603130 | 150 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | ABCA5-201 | ENST00000392676 | 8220 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNA5SP327-201 | ENST00000362494 | 101 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.396-201 | ENST00000383949 | 103 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORD72-201 | ENST00000390994 | 80 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | ZNF468-202 | ENST00000396409 | 384 nt | TSL 5 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU7-43P-201 | ENST00000516554 | 64 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORA70.22-201 | ENST00000517160 | 124 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC090821.2-201 | ENST00000523552 | 176 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Pinc.1-201 | ENST00000616452 | 154 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | LINC01359-207 | ENST00000634799 | 487 nt | TSL 5 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.24-201 | ENST00000362508 | 103 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.54-201 | ENST00000362766 | 105 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.82-201 | ENST00000363000 | 102 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |