Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERFP50548 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERFP50548 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERFP50548 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERFP50548 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERFP50548 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERFP50548 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERFP50548 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERFP50548 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERFP50548 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERFP50548 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERFP50548 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERFP50548 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERFP50548 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ERFP50548 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERFP50548 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERFP50548 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERFP50548 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERFP50548 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERFP50548 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERFP50548 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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