Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CRXO43186 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CRXO43186 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CRXO43186 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CRXO43186 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CRXO43186 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CRXO43186 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CRXO43186 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CRXO43186 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CRXO43186 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CRXO43186 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CRXO43186 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CRXO43186 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CRXO43186 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CRXO43186 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CRXO43186 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CRXO43186 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CRXO43186 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CRXO43186 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CRXO43186 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CRXO43186 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CRXO43186 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CRXO43186 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CRXO43186 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CRXO43186 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CRXO43186 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CRXO43186 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CRXO43186 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CRXO43186 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CRXO43186 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CRXO43186 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CRXO43186 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CRXO43186 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CRXO43186 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CRXO43186 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CRXO43186 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CRXO43186 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CRXO43186 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CRXO43186 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CRXO43186 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CRXO43186 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms