Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms